《指導意見》提出，要清晰界定省以下財政事權和支出責任。對于省以下財政事權的劃分，要適度強化教育、科技研發、企業職工基本養老保險、城鄉居民基本醫療保險、糧食安全、跨市縣重大基礎設施規劃建設、重點區域（流域）生態環境保護與治理、國土空間規劃及用途管制、防范和督促化解地方政府債務風險等方面的省級財政事權。將直接面向基層、由基層政府提供更為便捷有效的社會治安、市政交通、城鄉建設、農村公路、公共設施管理等基本公共服務確定為市縣級財政事權。

對于省以下財政支出責任的界定，要按照減輕基層負擔、體現區域差別的原則，根據經濟發展水平、財力狀況、支出成本等，差別化確定不同區域的市縣級財政支出責任。

《指導意見》提出，要理順省以下政府間收入關系。一方面，參照稅種屬性劃分收入，將稅基流動性強、區域間分布不均、年度間收入波動較大的稅收收入作為省級收入或由省級分享較高比例；將稅基較為穩定、地域屬性明顯的稅收收入作為市縣級收入或由市縣級分享較高比例。對金融、電力、石油、鐵路、高速公路等領域稅費收入，可作為省級收入，也可在相關市縣間合理分配。除按規定上繳財政的國有資本經營收益外，逐步減少直至取消按企業隸屬關系劃分政府間收入的做法。

另一方面，對主體稅種實行按比例分享，結合各稅種稅基分布、收入規模、區域間均衡度等因素，合理確定各稅種分享比例。除國家另有規定外，逐步取消對各類區域的財政收入全留或增量返還政策，確需支持的通過規范的轉移支付安排。逐步清理不當干預市場和與稅費收入相掛鉤的補貼或返還政策。

《指導意見》提出，要完善省以下轉移支付制度。建立健全省以下轉移支付體系，根據財政事權屬性，加大對財力薄弱地區的支持力度，健全轉移支付定期評估機制。

《指導意見》提出，要建立健全省以下財政體制調整機制。根據財政事權和支出責任劃分動態調整情況，結合省以下區域間經濟社會發展、財政收入分布和規模、財政收支均衡度等變化，適時穩步調整省以下政府間收入劃分。

此外，在規范省以下財政管理方面，《指導意見》提出，加強地方政府債務管理。落實省級政府責任，按屬地原則和管理權限壓實市縣主體責任，通過增收節支、變現資產等方式化解債務風險，切實降低市縣償債負擔，堅決查處違法違規舉債行為。健全地方政府債務限額分配機制，一般債務限額應與一般公共預算收入相匹配，專項債務限額應與政府性基金預算收入及項目收益等相匹配，促進融資規模與項目收益相平衡，完善專項債券資金投向領域禁止類項目清單和違規使用專項債券處理處罰機制。