經黨中央、國務院批準，2019年至2022年，第二輪中央生態環境保護督察分六批完成對31個省（區、市）和新疆生產建設兵團、2個國務院部門和6家中央企業的督察。

督察整改是生態環境保護督察的重要環節，是檢驗督察工作成效的重要標志。截至2023年6月底，第二輪督察整改方案明確的2164項整改任務，已完成1398項，完成率為65%，其余整改任務正在積極有序推進。

5省區和新疆生產建設兵團督察整改取得明顯成效，一大批重大生態環境問題得到有效解決。

督察整改期間，河北省積極推進白洋淀生態環境保護和治理工作，雄安新區容城縣、安新縣、雄縣三縣城區已累計完成雨污分流管網改造79公里，新建片區雨污分流建設隨片區開發建設進度同步推進實施。江蘇省啟動新一輪太湖治理，太湖藍藻水華平均面積、最大面積分別下降10.3%、46.8%，沿江生態岸線占比提高到64.1%。內蒙古自治區實施“一湖兩海”及察汗淖爾保護治理項目64項，呼倫湖、烏梁素海、岱海水質保持穩定，察汗淖爾流域生態環境穩定向好。西藏自治區實施生態安全屏障保護與建設規劃3大類10項工程，2022年共治理水土流失942.88平方公里，完成營造林117.9萬畝。新疆維吾爾自治區加快推進生活污水再生水利用，共建成投運達到一級A排放標準的污水處理廠102座，已建成“冬儲夏灌”中水庫（中水池）56座，2022年生活污水再生利用率達到43.4%。新疆生產建設兵團切實保障重點河湖流域生態用水補水，2022年奎屯河新渠首下泄生態水量15425萬立方米。